1905年早稻田大学清国留学生部来了一批浙江官派师范生，衢州府江山县杨文洵和王槱、常山县汪国庆、衢州府城刘泰钦、西安县孔昭仁（南孔世家）、玉山县（现属江西省）聂登期都在其中。这是目前为止有据可循的近代历史上衢州和日本的初次相遇。不过，因为各种原因100多年来，作为在日衢州人互助交流平台的同乡会一直没有建立起来。近年来，随着来日工作学习衢州人日渐增多，特别是2010年日本江山同乡会成立以来，衢州地区其他县市区的同乡也慢慢聚集起来。在衢州市外侨办和各县市区侨办的大力配合下，日本衢州同乡会应运而生。
2017年9月9日日本衢州同乡会成立；2017年9月10日衢州市领导访问静冈县挂川市考察农业旅游教育等。